巴斯德毕赤酵母细胞基因组DNA残留探针法荧光定量PCR试剂盒(不含内参)
Pichia pastoris Cell Residual Genomic DNA Probe Realtime PCR Kit
CAT#: XY9174Q
低温运输,-20℃保存
产品及特点:
巴斯德毕赤酵母,是甲醇营养型酵母中的一类能够利用甲醇作为唯一碳源和能源的酵母菌。与其它酵母一样,在无性生长期主要以单倍体形式存在,当环境营养限制时,常诱导2个生理类型不同的接合型单倍体细胞交配,融合成双倍体。巴斯德毕赤酵母的另一个生物学特点是,甲醇代谢所需的醇氧化酶被分选到过氧化物酶体中,形成区域化。以葡萄糖作碳源时,菌体中只有1个或很少几个小的过氧化物酶体,而以甲醇作碳源时,过氧化物酶体几乎占到整个细胞体积的80%,AOX增至细胞总蛋白的35%-40%。因此,当在AOX基因前利用同源重组方式插入外源蛋白基因时,可获得大量表达。同时,根据甲醇酵母这种可以形成过氧化物酶体的特性,既可利用该系统表达一些毒性蛋白和易被降解的酶类,也可用以研究细胞特异区域化的生物发生及其机制和功能,为高等动物类似的研究提供启示。本产品就是以探针法荧光定量 PCR 技术为基础开发的专门检测巴斯德毕赤酵母细胞基因组DNA残留的通用试剂盒,它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供样品 DNA 模板。
2. 引物和探针经过优化,灵敏性高。
3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4. 特异性高,引物是根据巴斯德毕赤酵母细胞基因组DNA残留高度保守区设计,不会跟其它病原DNA发生交叉反应。
5. 本产品足够 50 次 20μL 体系的探针法荧光定量 PCR反应。
6. 本产品只能用于科研。
规格及成分:
运输及保存:低温运输,-20℃保存,保存期限为 12 个月。
自备试剂:样品DNA。
使用方法:一、稀释标准曲线样品(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)。
由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
1. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
2. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
3. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品 DNA 的制备
7. 如果有 N 个样品,最好设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为 NC。
8. 用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数 DNA 提取试剂盒兼容。
三、Probe qPCR 反应(20μL 体系,在样品制备室进行)
9. 如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个 PCR管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于 PCR 阳性对照(用第 4 号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
11.盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
四、数据处理
12. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 RNA浓度的 log 值,再推算出其浓度。
11. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为阳性。如果在 35-40之间,则重复一次。若重复结果 Ct值小于40,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性。